В настоящее время в состав ГУП «Мосгортранс» входят следующие автобусные парки и филиалы:
Городские перевозки:
Филиал «Юго-Западный»:
** Введенская площадка 1-й автобусный парк (1АП)).
** Очаковская площадка 14-й автобусный парк (14АП)).
** Новоясеневская площадка 18-й автобусный парк (18АП)).
Филиал «Северо-Восточный»:
** Бибиревская площадка (бывш. 3-й автобусный парк (3АП)).
** Анненская площадка (бывш. 6-й автобусный парк (6АП)).
** Нижнелихоборская площадка (бывш. 7-й автобусный парк (7АП)).
** Площадка Бочкова (бывш. 6 троллейбусный парк, ныне — парк электробусов).
Филиал «Восточный»:
** Площадка Кабельная (бывш. 2-й автобусный парк (2АП))
** Площадка Новокосинская (бывш. 4-й автобусный парк (4АП); НАТП)
** Площадка Монтажная (бывш. 10-й автобусный парк (10АП))
Филиал «Центральный»:
** Основная (Давыдовская) площадка (бывш. Филёвский автобусно-троллейбусный парк (ФАТП) - автобусы и электробусы).
Филиал «Западный»
** Волоколамская площадка (бывш. 15-й автобусный парк (15АП)).
** Силикатная площадка (бывш. 5-й автобусный парк (5АП)).
Филиал «Южный»
** Каширская площадка (бывш. 16-й автобусный парк (16АП)).
** Нагатинская площадка (бывш. 9-й автобусный парк (9АП)).
** Площадка Андропова (бывш. 13-й автобусный парк (13АП)).
Филиал 17-й автобусный парк (17АП).
Филиал «ЗелАК»:
** Основная (Зеленоградская) площадка.
** Левобережная площадка (бывш. 11-й автобусный парк (11АП)).
Служебные перевозки:
Филиал «Служба заказных перевозок (СЗП)»
Закрытые и ликвидированные автобусные парки ГУП «Мосгортранс»:
- 12-й автобусный парк (12АП)
- Коммерческий автобусный парк (КАП)